C'est certainement le point négatif de cet arc à savoir Nagato changer d'avis si vite.
On peut le voir aussi (du moins c'est mon point de vue) comme une reconnaissance de sa défaite suite à la réponse qu'apporte Naruto à savoir de perpétuer le nindo de son maitre alias Jiraya.
Suite à cette réponse on peut le voir se remémorer ce que Jiraya voyait en lui, Nagato, donc dans l'état physique qu'il était il ne pouvait pas faire grand chose de toute façon surtout que l'auteur par cette décision que prend Naruto renforce l'idée que Naruto est bien l'enfant de la prophétie capable de changer les gens même Nagato.